Quelque 10 000 étudiants et étudiantes sont immatriculés à l'Université de Berne. Une bonne moitié d'entre eux viennent du canton de Berne, l'autre des autres cantons et de l'étranger. Les femmes représentent 44 pour cent des étudiants.

L'Université propose des études dans les facultés suivantes : Faculté de droit et des sciences économiques, Faculté des lettres, Faculté des sciences, Faculté de médecine, Faculté de médecine vétérinaire, Faculté de théologie évangélique, Faculté de théologie catholique chrétienne. A ces facultés viennent s'ajouter les instituts de formation du corps enseignant pour la partie alémanique du canton.

Les étudiants et les étudiantes sont encadrés par 3 200 personnes actives dans l'enseignement et la recherche, l'administration ou les services techniques. Pour choisir leurs études, ils peuvent demander conseil au Service d'orientation universitaire, et pour obtenir des conseils personnalisés pendant leurs études, ils peuvent s'adresser au Service de conseil de l'Université et de la Haute école spécialisée.

Pour pouvoir commencer des études, il faut s'être préinscrit ; les étudiants et les étudiantes sont en principe libres dans le choix de leur filière, sauf en médecine où le nombre d'admissions peut être limité. Les cours de l'Université de Berne sont ouverts avant tout aux titulaires d'une maturité gymnasiale. Les études sont sanctionnées par un diplôme, une licence ou un examen d'Etat. Une partie des étudiants et des étudiantes poursuivent encore leurs études pour passer un doctorat. De plus amples informations sont fournies dans le Studienführer Uni Bern (guide à l'usage des étudiants et des étudiantes de l'Université de Berne).

L'Université coordonne les études qu'elle propose avec les autres universités suisses. Elle collabore très étroitement avec les universités de Neuchâtel et de Fribourg. Elle participe en outre à des programmes européens d'échange d'étudiants et d'étudiantes.

L'Université de Berne comprend un Centre de formation continue proposant des cours et des formations postgrades. Elle propose également des manifestations générales et interdisciplinaires ouvertes à un large public.

L'organe suprême de l'Université est le Sénat dans lequel sont représentés toutes les facultés, le corps intermédiaire et les étudiants. L'Université est dirigée et coordonnée par la direction de l'université avec, à sa tête, le recteur ou la rectrice. La surveillance ressortit à la Direction de l'instruction publique. Les intérêts des étudiants et des étudiantes sont représentés par l'Association des étudiants et des étudiantes. L'Université dispose d'une grande autonomie.